Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem52bQ0VBF2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem52bQ0VBF2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms