Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1bQ0MW30 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms