Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NeblQ0II04 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms