Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc21bQ0HA38 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms