Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms