Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms