Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms