Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms