Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf3Q07104 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms