Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Caprin2Q05A80 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Caprin2Q05A80 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms