Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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