Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col10a1Q05306 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col10a1Q05306 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms