Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc2Q05020 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms