Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox8Q04886 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms