Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top1Q04750 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Top1Q04750 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms