Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelaQ04207 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelaQ04207 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms