Protein–RNA interactions for Protein: Q03288

Asip, Agouti-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsipQ03288 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AsipQ03288 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
AsipQ03288 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AsipQ03288 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms