Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms