Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gjb5Q02739 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms