Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Htr1fQ02284 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr1fQ02284 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr1fQ02284 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr1fQ02284 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr1fQ02284 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htr1fQ02284 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr1fQ02284 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htr1fQ02284 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms