Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd1Q02242 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms