Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms