Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms