Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms