Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2aQ01320 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2aQ01320 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms