Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms