Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms