Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga4Q00651 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms