Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms