Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb4P99026 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms