Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brca2P97929 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms