Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gfra1P97785 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra1P97785 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra1P97785 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra1P97785 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gfra1P97785 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms