Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cited1P97769 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cited1P97769 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms