Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata5P97489 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata5P97489 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms