Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmklr1P97468 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms