Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig3P97386 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms