Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab3P97382 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms