Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1aP97357 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1aP97357 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms