Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl21cP86793 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccl21cP86793 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccl21cP86793 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccl21cP86793 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccl21cP86793 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccl21cP86793 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccl21cP86793 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccl21cP86793 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccl21cP86793 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccl21cP86793 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl21cP86793 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccl21cP86793 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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