Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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