Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElocP83940 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElocP83940 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElocP83940 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElocP83940 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElocP83940 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElocP83940 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElocP83940 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElocP83940 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElocP83940 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElocP83940 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElocP83940 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElocP83940 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms