Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms