Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubg1P83887 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubg1P83887 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms