Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tp53bp1P70399 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms