Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms