Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1P70338 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms