Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux2P70298 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux2P70298 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux2P70298 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cux2P70298 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms