Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NficP70255 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NficP70255 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NficP70255 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NficP70255 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NficP70255 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NficP70255 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NficP70255 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms