Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SbdsP70122 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SbdsP70122 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms