Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Acta1P68134 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms